Земля Франца-Иосифа и прилегающая к ней акватория играет исключительную роль для обеспечения воспроизводства и устойчивого существования многих популяций арктических видов.
Во-первых, Земля Франца-Иосифа является важнейшим с природоохранной точки зрения районом западного сектора Арктики, здесь обитает пять видов, занесенные в Красную книгу Российской Федерации и Международную Красную книгу.
Во-вторых, архипелаг играет важную роль для сохранения и поддержания орнитологического разнообразия Российской Арктики.